Al margen de estas leyendas se sabe que Nuestra Señora de la Encina era ya venerada en la antigua ermita en 1504 y que la gente al morir dejaba parte de su herencia a la Virgen para que se dijesen misas por el eterno descanso de sus ánimas en la ermita. Un ejemplo es el collar de oro y la toca que lega la mujer de Juan Terracos el 4 de octubre de 1592 para vestir a la Virgen.
En 1609 un Visitador eclesiástico dice: «Aquí hay una ermita de Nuestra Señora de la Encina, muy bien tratada, que podía ser iglesia de monjas, su capilla muy bien enmaderada y su retablo muy bueno; no tiene renta esta ermita, aunque las limosnas son muchas, se gastan en reparar la ermita, en fiestas y misas«. Poseía además de las limosnas una alameda de negrillos (en la calle Alameda), huertos entre la alameda y la ermita, parte del terreno del actual camposanto, y unas viñas y tierras de labranza.
En 1730 D. Juan Francisco Caballo Labajos, residente en América manda un collar de oro puro para la Virgen el cual se le ponía en su fiesta y para el día del Encuentro el Domingo de Resurrección.
En esta ermita primitiva se celebraba el día 15 de agosto la Asunción de María, esto se deja de hacer el año 1727 por la afluencia de macoteranos y forasteros y porque muchos de ellos se subían a la tribuna y ésta amenazaba a ruina.
Esta ermita sirvió en el siglo XIX de escuela de primeras letras para niños y adultos.
En el año 1971 se tiró esta antigua ermita y se construyó una nueva que es la actual. Tiene esta ermita un Calvario estimable y un San Nicolás Tolentino al que algunos dicen que es el patriarca Noé, por tener en sus manos un tonel.
